课程退款时被培训机构扣了10%手续费，这合理吗

不合理，除非合同有明确规定。根据《民法典》相关规定，退款扣手续费需双方协议约定，若无明确条款，扣10%可能不合理。若未协商同意就扣费，可能侵犯您的财产权。严重后果是您的合法权益受损。
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常见处理方式为协商或诉讼。可先与培训机构协商退款事宜，协商不成可考虑通过法律途径维权，如提起诉讼，依据合同条款和相关法律规定争取权益。
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不合理。处理方式如下：首先，查看合同有无相关手续费条款；其次，若无，可与机构协商全额退款；协商无果，向消费者协会投诉或提起诉讼，要求退还不合理扣费，并赔偿损失。